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2019年2月6日水曜日

pip install mpi4py したら mpi.h がないと怒られた件

Ubuntu 18.04 LTS 環境下のPython3(python3-dev)で


pip install mpi4py

したら、

    _configtest.c:2:10: fatal error: mpi.h: No such file or directory
     #include
              ^~~~~~~
    compilation terminated.
    failure.
    removing: _configtest.c _configtest.o
    error: Cannot compile MPI programs. Check your configuration!!!
   
    ----------------------------------------

Command "/home/tasuku_hori/env/bin/python3 -u -c "import setuptools, tokeni
ze;__file__='/tmp/pip-install-8php8m1j/mpi4py/setup.py';f=getattr(tokenize,
 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec
(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-record-xt1ud26
w/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --instal
l-headers /home/tasuku_hori/env/include/site/python3.6/mpi4py" failed with
error code 1 in /tmp/pip-install-8php8m1j/mpi4py/


というエラーが出た。

いろいろ調べてみたら、

sudo apt install -y libopenmpi-dev

を実行後再度実行すると成功した。


調べている間、openmpi-binだとかmpichだとかをapt install しろ書いてあったが
私の環境では libopenmpi-dev だった。

ご参考まで。

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